Se puede montar un motor m96/22 con cambio automático en uno con cambio manual

Hola a todos tengo un boxter 986 y se me ha ido el cigueñal he encontrado un bloque usado con 90.000km pero estaba montado en un boxter con cambio automático el mío es con cambio manual lo he montado y no arranca con el volante motor de mi coche solo funciona el banco de cilindros 1-3 pero si monto el volante motor que traía el bloque usado consigo arrancarlo con dificultad pero no se queda en ralenti y además se me enciende la luz de averia motor y me da averia del banco de cilindros 4-6.
He mirado la compresión de los cilindros y tengo los 6 sobre 9.5 bares de presión es correcta la compresión alguien me puede ayudar gracias.